وفاء بالتزامات التعاون مع المؤسسات التعليمية  والهيئات الدولية الكبرى، كونت جامعة الوفاق منذ التأسيس مجموعة من المجالس والهيئات واللجان العلمية والإدارية والمالية تقوم بمسؤوليتها الكاملة طبقا لما هو منصوص في اللوائح الداخلية  للجامعة